結合工廠化循環水養殖系統的特點，研究開發出節能環保，占地面積少，土地使用效率高，能有效隔離病害和控制病源的侵入，降低魚苗的攜菌和發病率的封閉式工廠化養殖循環水處理系統：在臺風自然災害較多的南方，工廠化循環水養殖可有效抵御自然災害對水產養殖業毀滅性的打擊。在循環水養殖系統中，重要的就是水質的凈化處理，這關乎到水產養殖的成敗。目前，傳統的循環水養殖系統由于大量電力化設備的使用，能耗特別高，加之部分設備耐腐蝕性差，成為現在做循環水養殖頭疼的事情。

水霉病對水產動物沒有選擇性，凡是受傷的都有被感染的可能，水霉菌是腐生性的，它不感染健康無傷的魚。因為活細胞具有“抗霉s”，“抗霉s”很可能存在于黏液分泌細胞所分泌的黏液中，細胞一死，就停止分泌黏液，水霉菌孢子很快寄生上去。疾病早期基本沒有癥狀，當肉眼能發現癥狀時候，菌絲已經在傷口侵入并向外長出外菌絲，似灰白色的綿毛狀，俗稱“生毛”或白毛病。霉菌可以分泌大量的蛋白酶，機體受刺激后能分泌大量的粘液。

目前普通的養殖技術都是基于自然或傳統養殖模式條件下魚類的生理活動研究成果，但是在工廠化高密度條件下，魚類受到環境脅迫，生理狀況會有顯著變化，水生態環境更為單一，養殖技術應有相應的調整。我國目前在該領域的研究嚴重滯后于生產，無法提供成熟的養殖工藝，設施的效能不能得到發揮。部分配套技術的發展也不均衡，比如飼料品質普遍較差，營養轉移效率低且不穩定，增加了設施系統的處理負荷，導致綜合效益下降。因此，需要針對工廠化循環水養殖的系統條件，研究發展配套的養殖技術。