生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統應為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。

養魚先養水。水質方面有氨氮、亞鹽、ph、硬度、鹽度(淡水魚)、大腸桿菌。水質凈化使用虹吸方式。一來可以進化水質，二來溶氧很方便，三來會推水，一舉多得。基質使用1-2CM規格的火山巖或者陶粒，需要提下的是同體積火山巖的硝化效能是陶粒的好幾倍。其他還可以采用的有人工燒結的球型濾材，觀賞魚那里經常使用，但是成本較高。如果不種植植物還有毛刷生化球可選，但這個項目不在此次經驗分享里。如果水源水好的話養出的魚品質更好，同時水溫合適也能省更多的成本。 因為不向外排水，所以長期運行后水會很肥。

項目投產前，首先需要決定養殖品種：因為底息類的魚池設計有區別，同時還需要對生物習性了解清楚：喜歡靜水，還是喜歡頂水；適宜水溫等等條件，不一而足。再了解了生物習性后，工廠化循環水養魚成功與否取決于以下幾個主要條件：溶氧量、水質、水溫，如果是海魚的話還有鹽度。副條件還有：ph、硬度、鹽度(淡水魚)、光照等。買魚苗后先進行觀察篩選（15天以上），把那些狀態不好的，比如明顯有寄生蟲、殘疾等不適合的剔除了，省的以后麻煩。在觀察期間還會死魚，除了體質問題外，還有一個因素是水體各元素含量不同導致的。