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陜西哪里有二代測序原理

來源: 發布時間:2024-12-27

不同二代測序技術平臺的速度

Illumina 測序平臺:這是目前市場上應用較為***的二代測序平臺之一,其測序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運行可以在 1-3 天內產生大量的數據,通量可達數億甚至數十億條讀長,能夠滿足大規模基因組學研究和臨床檢測的需求。

Roche 454 測序平臺:Roche 454 測序系統的測序速度也較快,其特點是測序片段比較長,高質量的讀長能達到 400bp 左右,一次運行可以在 24 小時左右完成對一定數量樣本的測序。

BGISEQ 系列:華大智造的 BGISEQ 系列測序儀在速度上也有出色表現,如全球二代測序速度**快設備 E25 量產,為快速測序提供了有力支持 二代測序的工作原理是什么?陜西哪里有二代測序原理

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二代測序——RNA甲基化的概念、作用和檢測方法

RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基團,其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常見的一種 RNA 甲基化修飾形式,它主要發生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)殘基上。

作用

1、影響 RNA 的穩定性:m6A 修飾可以影響 mRNA 的穩定性。例如,一些帶有 m6A 修飾的 mRNA 更容易被降解,從而調控基因表達的時間和水平。2、調節 RNA 的剪接和翻譯:m6A 修飾還能夠調節 mRNA 的剪接過程,影響不同轉錄本的生成。同時,它也可以在翻譯水平上發揮作用,影響蛋白質合成的效率。

檢測方法

甲基化 RNA 免疫沉淀測序(MeRIP - Seq):這種方法主要是利用特異性識別 m6A 修飾的抗體,對 RNA 進行免疫沉淀富集,然后通過高通量測序來鑒定 m6A 修飾的位點和水平。 長寧區嘉安健達二代測序RNA測序也是二代測序。

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宏基因組二代測序,你了解多少?

宏基因組二代測序(mNGS)是一項覆蓋病原譜廣且高通量的檢測技術,已在臨床領域得到了廣泛的應用。對于血液病患者,病原mNGS通過對樣本快速高通量測序,可以獲得更準確、相對無偏倚的病原信息,對病原診斷起到積極的作用,尤其對傳統微生物學檢測未覆蓋到或檢測周期較長、陽性率較低的病原可提高檢出率。對于臨床相關樣本應首先完善傳統微生物學檢測,病理、無菌標本培養仍然是診斷的金標準,病原mNGS是對傳統微生物學檢測的有力補充和延展而非替代。病原mNGS的報告解讀應充分評估檢出微生物的致病性、流行病學、生物信息學信息,同時在結合患者臨床特征的基礎上進行綜合判斷。

二代測序的建庫步驟③

三、末端修復和加A尾(以DNA文庫為例)

末端修復:經過片段化后的DNA末端可能是不平齊的,有5'-突出端或3'-突出端。末端修復反應可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶,將這些末端補平,使其成為平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,在合適的反應緩沖液和dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)存在下,可以將突出的末端補平。

加A尾:在末端修復后的平末端DNA分子的3'-末端加上一個A堿基。這一步是為了后續連接帶有T-突出端的接頭做準備,一般使用Klenow片段(3'→5'外切酶活性缺失)在dATP存在下進行加A反應,這樣可以使DNA片段能夠高效地與帶有T-突出端的測序接頭連接。 二代測序通量大,可以產生上G的reads.

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二代測序—全外顯子測序的應用領域

醫學領域:1、疾病診斷:用于診斷各種遺傳性疾病,包括單基因遺傳病(如囊性纖維化、杜氏肌營養不良等)和復雜疾病(如**、心血管疾病等)。在**研究中,通過對**組織和正常組織進行全外顯子測序,可以發現腫瘤細胞中的體細胞突變,這些突變可能是導致**發生、發展的關鍵因素,有助于醫生制定個性化的治療方案。2、藥物研發:幫助研究人員了解藥物靶點的基因變異情況。例如,如果發現某些患者的藥物靶點基因外顯子區域存在突變,可能會影響藥物的療效,從而可以針對性地開發新的藥物或者調整藥物的使用劑量和方式。

遺傳學研究:用于研究人類群體的遺傳多樣性,通過對不同人群的外顯子測序,可以發現不同人群之間的基因差異,這些差異可能與人群的適應性、易感性等有關。還可以用于追蹤基因的進化歷程,了解基因在進化過程中的變化情況。 二代測序廣泛應用于醫學研發。天津二代測序技術

什么是二代測序技術?陜西哪里有二代測序原理

二代測序的建庫步驟⑥

六、文庫質量檢測

定量檢測:使用熒光定量PCR(qPCR)或其他核酸定量方法(如Qubit)來確定文庫的濃度。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結合的定量方法,它可以準確地測量DNA或RNA的濃度,并且對不同大小的核酸片段有較好的定量準確性。通過定量檢測,可以了解文庫的產量,為后續的測序上樣量提供參考。

片段大小檢測:利用瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀(如Agilent2100Bioanalyzer)來檢測文庫片段大小。瓊脂糖凝膠電泳是一種傳統的方法,通過將文庫樣品在瓊脂糖凝膠中進行電泳,根據DNA片段在電場中的遷移速度來判斷片段大小。生物分析儀則可以提供更精確的片段大小分布和濃度信息,它是基于微流體芯片技術,能夠快速、準確地分析文庫質量。 陜西哪里有二代測序原理

標簽: 二代測序