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深圳銳訊數字PCR

來源: 發布時間:2023-02-04

數字PCR技術流分類目前,dPCR的基本方法都已經建立,根據反應單元的不同形式,主要可分為微板式、微腔式和和微滴式三大類系統。微液滴制備的方法,目前主流的有四種:1)芯片微孔物理分割法,俗稱物理分隔法,公司有Fluidgm,Qiagen,Roche,ThermoFisher,;2)液滴分割法,俗稱油包水,代替公司有Bio-Rad;3)雜交式芯片液滴法,公司有Stilla;4)注射振動制滴法。PS:芯片式物理分割技術所有已經過期,目前有不少公司在這個技術的基礎上進行開發,例如羅氏。數字PCR是通過將一個樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應單元,每個單元至少包含一個拷貝的目標分子 。深圳銳訊數字PCR

現有dPCR分析方法采用熒光探針和基于光的檢測方法來鑒定擴增產物。這些方法要求足夠的靶分子擴增以產生足以被檢測到的信號,但可能會導致額外的錯誤或偏差,因此,希望能夠提供一種改進的、用于檢測樣品內感興趣的核酸的方法,其采用替代性分析方法,具有提高的準確度和精確度,并且其具有可以與基于dPCR的方法關聯使用的靈敏度。dPCR還在樣品內進行單一反應,但是所述樣品被分離成大量的分區(partition),并且所述反應在每個分區中單獨進行。這種分離允許對核酸量進行靈敏的測量。DPCR已被證明可有效用于研究基因序列中的變異,例如拷貝數變異或點突變。深圳銳訊數字PCR模板 DNA 量越多,熒光達到域值的循環數越少,即 Ct 值越小。

數字PCR平臺的評價指標有:分割單元數,熒光通道數,操作復雜性和污染風險。但是重要的是檢測準確性,評估數字PCR平臺的一種方法是使用多個數字PCR平臺互相驗證,另一種方法是使用定值準確的標準物質。目前的三代的PCR技術各有各的優缺點,也各有各的應用領域,并不是一代取代一代的關系。技術的不斷進步給PCR技術注入了新的活力,使其能解鎖一個又一個的應用方向,使核酸檢測更方便、更準確。目前dPCR儀器的價格仍然十分昂貴,但隨著系統加工工藝的改進以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價格將會不斷的降低,使其應用到更多的檢測中。

dPCR的結果統計方式有2種,一種是采用標記多種顏色,通過不同檢測通道分辨不同顏色和強度,再根據分散液滴的數量計算待測基因的含量;另一種采用概率統計的數據處理方法,即通過泊松分布的方法對結果進行分析。應用概率統計分析數據和對數據處理方法的模型直接關系著結果的準確性和分析時間的長短。常用的統計方法是假設每個微反應單元的體積相同,根據泊松統計計算拷貝數,公式為:M=-Vx1n(1-x/)其中M是目標總拷貝數量;V是微反應單元數量;x是發光的微反應單元數量。數字PCR等新興技術要在臨床應用上得到爆發式增長,有賴于LDT市場的放開。

dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結果偏差。體積誤差對于測量拷貝數濃度會產生偏差。目前dPCR中體積優化方法以光學顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數結果的不確定性,Emslie等使用光學顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數字PCR系統中每個微孔內和孔與孔間的體積差異對實驗結果的影響程度。Corbisier等使用微滴數字PCR對6種不同質量分數棉籽粉質粒DNA標準物質[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進行分析,優化了液滴體積得到相應校正因子,并使用該校正因子發現并校準了運行軟件中液滴體積不變的假設而引起的數據偏離,數據結果的一致性有明顯提高。經過PCR循環之后,有一個核酸分子模板的反應器就會給出熒光信號,沒有模板的反應器就沒有熒光信號。廣州銳訊數字PCR市場前景

無創產前篩查有望成為數字PCR在臨床快速落地的應用。深圳銳訊數字PCR

ThermoFisherQuantStudio3D是另一個經典的芯片式數字PCR平臺,其基本的檢測流程是:將反應液加入到涂布器中,通過涂布器將反應液均勻涂布在有20000個微孔的芯片上,將芯片放在PCR儀上擴增,將芯片放入讀取儀中采取拍照的方式讀取熒光信號。操作較為復雜,整個過程在封閉的芯片中進行,污染的風險較低。STILLANaica是一個較新的數字PCR平臺,基本的檢測流程是:將反應液加入芯片,將芯片放入微滴生成擴增系統,生成30,000個微滴單層平鋪于芯片中,PCR擴增在芯片上完成。然后將擴增后的芯片轉移至微滴閱讀分析系統,采取拍照的方式讀取熒光信號。由于整個過程在封閉的芯片中進行,污染的風險較低。深圳銳訊數字PCR

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