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廣州國產數字PCR性能特點

來源: 發布時間:2023-02-05

相比于qPCR,dPCR在轉基因檢測中具有以下優勢:(1)檢測靈敏度高:理論上dPCR的靈敏度可達1個拷貝,而實際應用中dPCR的小檢出限和比較低定量限數值非常接近,所以dPCR可以在非常低的目標拷貝數下得到精確的結果;通常轉基因比參考基因(內源基因)濃度低很多;(2)前處理簡單且受基質成分干擾較小:dPCR反應效率和精密度受到食品基質成分干擾影響較小,可應用于混合基質樣品中低豐度DNA的檢測;(3)dPCR對抑制劑的敏感性較低:由于dPCR結果表示為“有熒光“或“無熒光”,即使存在抑制劑降低了熒光強度仍可以表示為“有熒光;(4)適合多重轉基因檢測:食品或飼料提取的DNA中可能包含多種轉基因片段,可以進行多重dPCR檢測,提高分析效率。同時,dPCR可以直接溯源至SI國際單位制摩爾,適合單一、雙重及多重轉基因標準物質研究,一次可識別不同的轉基因區域。下面詳細進行說明。dPCR的測量結果通常表示為含量,即拷貝數轉基因質量百分比,而QPCR結果通常表示為拷貝數的質量分數。廣州國產數字PCR性能特點

數字PCR技術的出現不是為了完全取代原有分子診斷技術,而是更好的補充和完善現有技術平臺。數字PCR為不同應用場景下的多樣化核酸檢測需求提供了新的思路,尤其是在臨床檢測方面。國產數字PCR企業在商業化應用方面,也不斷“攻城略地”。數字PCR作為當下靈敏的核酸檢測技術,盡管目前國產數字PCR企業異軍突起,在臨床市場中實現了彎道超車,但未來仍然需要聚焦客戶需求,不斷夯實底層創新,同時在檢測成本、自動化、試劑盒申報注冊、出海國際化等方面不斷努力,提供更為的解決方案。國際局勢,波譎云詭。在百年未有之大變局,實現中華民族的偉大復興,需要國內企業瞄準技術高地,以爭分奪秒的精神,解決技術"卡脖子"的難題,不斷攻堅克難,自主創新,在與國際品牌的同臺競技中,彰顯中國實力。珠三角國產數字PCR分析應用使用數字PCR技術對436例非小細胞肺*樣品進行檢測,并挑選樣本驗證一致性。

對于檢測需要高靈敏度以及技術確認的情況下,數字PCR技術也可以發揮重要作用。技術數據表明,數字PCR技術對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經測試,數字PCR在檢測和診斷的某些方面優于金標準qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數字PCR特異性、靈敏度、重現性和檢測限受影響更小。因此,未來預計數字PCR技術也將在類疾病中得到更加廣的應用。數字PCR的應用甚廣,除了可應用于進行突變的檢測以外,也可運用于基因擴增的檢測。通過數字PCR技術可建立多重熒光體系,用于同時檢測比如非小細胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴增。有研究報道,使用數字PCR技術對436例非小細胞肺樣品進行檢測,并挑選樣本驗證了數字PCR與RNA fish的檢測一致性。結果表明,該數字PCR技術在保證了基因擴增檢測準確性的同時,還節約了檢測時間。

二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標實體隨機“投擲”到一組分區中,當目標落在選定的分區中時,就是成功。如果有n個分區,并且分區過程是完全隨機的,則目標出現在所選分區中的概率為1/n。該試驗重復m次,樣品中的每個分子一次。更多關于PCR的相關信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學儀器有限公司。在dPCR中,樣品被分區,使得樣品內單個的核酸分子被定位并被集中在許多分離的區域內。

基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術,將樣品平均分配到20000個微滴油包水中,利用微滴分析儀對微滴進行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅動下,將每個標準反應體系分割成包含100萬至1000萬個皮升級別微滴的反應乳液。數字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數字PCR,其原理都是有限稀釋,終點PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標準PCR反應體系,平均分配成幾萬個PCR反應,分配到芯片或微滴中,使每個反應中盡可能含有一個模板分子,進行單分子模板PCR反應,通過讀取熒光信號的有或無進行計數,經過統計學泊松分布的校準進行定量。數字PCR是直接數出DNA分子的個數,是對起始樣品的定量。珠三角國產數字PCR分析應用

dPCR的結果統計方式有2種,一種是采用標記多種顏色,另一種采用概率統計的數據處理方法。廣州國產數字PCR性能特點

產物越短,往往擴增效率越高。模板二級結構(Templatesecondarystructure):PCR變性中和變性后的單鏈DNA不夠穩定,容易自發折疊形成二級結構。應避免可形成穩定二級結構的模板鏈區域,因為如果模板鏈形成的二級結構在退火溫度下穩定存在,定位在模板鏈二級結構處的引物將無法同模板鏈相結合。使用mfold可預測引物待結合的區域是否存在復雜的二級結構。設計引物時,盡量使引物定位在模板二級結構以外的序列上。避免具有4個以上相同的連續堿基的區域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸階段聚合酶“滑動(PolymeraseSlippage)”。選擇GC含量(GCContent)在50-60%之間的區域。如果高GC含量區域不可避免,可以嘗試提高退火溫度,并使用添加劑,例如甘油,廣州國產數字PCR性能特點

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