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北京莖環法逆轉錄

來源: 發布時間:2023-03-30

反轉錄酶的注意事項,在進行RT反應之前,應考慮以下幾個方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質量的RNA,高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時在逆轉錄反應中經常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放結合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實驗過程中經常更換新手套。逆轉錄技術可以進行從RNA到DNA的轉化,從而保護RNA序列的完整性。北京莖環法逆轉錄

miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA加尾法逆轉錄:增加miRNA逆轉錄產物長度較直接的方法就是增加miRNA的長度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后進行逆轉錄反應。因此,加尾法是由兩個酶共同作用完成的,它們分別是PolyA聚合酶和逆轉錄酶。PolyA聚合酶負責給miRNA加上PolyA尾,增加其長度。之后逆轉錄引物結合到PolyA序列上,由逆轉錄酶完成加長版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR中的qPCR:miRNA熒光定量PCR的過程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆轉錄產物的5端均為通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根據miRNA序列設計的正向引物。正向引物的特異性就變得非常重要。對于內參,生工生物的miRNA加尾法首先鏈cDNA合成試劑盒(B532451)中內置了內參U6的正向引物,使用該引物與通用引物R即可進行內參U6的擴增。杭州一體化逆轉錄酶測序逆轉錄PCR反應過程中要注意反應管中溶液面積不宜過高,避免泡沫問題。

逆轉錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉錄。逆轉錄與反轉錄嚴格意義上來說沒有什么區別,但是逆轉錄是某些病毒的自主行為,如逆轉錄病毒,它們在整合到宿主細胞內前以RNA為模板形成DNA的過程;反轉錄是進行基因工程過程中,人為地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之為模板人工合成DNA的過程。二者雖同為RNA→DNA的過程,但地點不同,相對性的來說,逆轉錄在體內,反轉錄在體外。

RT-PCR逆轉錄引物設計原則:1.上下游引物要保守:擴增子長度需選擇一段保守片段(100-200bp)進行PCR擴增,選擇片段需跨越內含子,因內含子的基因組DNA序列不會被擴增,也可減少從污染的基因組DNA中擴增得到的假陽性風險。引物選取同樣需要保守。2.引物長度和Tm值:引物設計長度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設計引物時盡量避免出現4個或超過4個G堿基。RT-PCR實驗陰性對照:反轉錄陰性對照應包括在所有的RT-PCR的實驗中,用來檢測DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產物)。該對照所指不加反轉錄酶,通過反轉錄過程得到cDNA在進行熒光定量PCR檢測。如檢測到擴增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。HIV病毒復制的一個重要步驟就是逆轉錄。

反轉錄酶的用處:由它催化轉錄合成的DNA稱為互補DNA(cDNA)。通常情況下,細胞內的轉錄應由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實現自身擴增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉錄合成cDNA再由cDNA轉錄出RNA。逆轉錄酶可用RT—PCR,將RNA轉變為DNA后擴增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發現了反轉錄酶,并認為此酶與病毒的致死性質有關。反轉錄酶也分布于某些正常細胞和胚胎細胞。反轉錄酶的發現表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質非常化,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進了分子生物學、生物化學和病毒學的研究,已成為研究這些學科的有力工具。實時熒光PCR檢測需要經過逆轉錄反應。深圳彩色反轉錄生產廠家

逆轉錄實驗在反應前應將各反應試劑混勻,避免試劑沉淀或剪切。北京莖環法逆轉錄

逆轉錄PCR的用途普遍,可用于分析基因的轉錄產物、檢測細胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探針、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在臨床上RT-PCR可以用于遺傳病診斷、病癥檢測、檢測病人標本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究環境脅迫對植物基因表達的影響,以及在特定的環境或生長階段中植物體不同部位基因表達的差異性。使用RT-PCR檢測分析RNA轉錄產物具有以下突出的優點:理論上可以檢測幾乎任何基因的轉錄產物;可以實現極為微量RNA樣品(ng級別)的檢測;樣品耐受性好,未經純化的粗制生物樣品也可以用于檢測。北京莖環法逆轉錄

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