RIP實(shí)驗(yàn)的目的是使用RIP-seq或者RIP-qPCR的方法,通過(guò)在目的細(xì)胞中運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),經(jīng)過(guò)分離純化并對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的RNA進(jìn)行測(cè)序或qPCR分析,尋找目標(biāo)蛋白的互作RNA分子,或在不同遺傳背景或處理?xiàng)l件下的互作變化。廣州基云生物擁有ZI深的項(xiàng)目管理ZHUAN家和經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì),為您提供專業(yè)的研究方案、嚴(yán)格項(xiàng)目質(zhì)控、科學(xué)的數(shù)據(jù)分析,為您的互作機(jī)制提供專業(yè)建議,助力您快速獲取互作機(jī)制分子,突破互作機(jī)制研究瓶頸難題。RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)有哪些應(yīng)用場(chǎng)景。內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR
RIP實(shí)驗(yàn)RNA結(jié)合蛋白-RNA復(fù)合物的免疫沉淀(RIP)免疫沉淀方法:
將所有的試管在4°C下旋轉(zhuǎn)孵育3小時(shí)至過(guò)夜。
將免疫沉淀管短暫離心,放置在磁性分離器上,棄用上清液。
從磁鐵上取下試管。每管中加入0.5mLRIP洗滌緩沖液,短暫渦旋。(重復(fù)清洗5次)
在后面一次洗滌中,將500μL的珠子懸液中各取出50μL,通過(guò)免疫印跡法檢測(cè)免疫沉淀的效率。在1XSDS-PAGE加載緩沖液中重新懸浮珠子,然后在95°C加熱,可以洗脫蛋白質(zhì)。然后可以離心,上清液直接應(yīng)用于SDS-PAGE上。 新疆RNA蛋白相互作用RIP qPCR進(jìn)行RIP-qPCR實(shí)驗(yàn),應(yīng)該注意哪些關(guān)鍵問(wèn)題,以確保實(shí)驗(yàn)的成功和準(zhǔn)確性。
做好RIP-qPCR實(shí)驗(yàn),需要做好以下準(zhǔn)備:一、實(shí)驗(yàn)材料與試劑。細(xì)胞或組織樣本:確保樣本新鮮、無(wú)污染,并符合實(shí)驗(yàn)需求。特異性抗體:針對(duì)目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白的抗體,用于免疫沉淀。qPCR引物:特異性針對(duì)目標(biāo)RNA的引物,用于后續(xù)定量檢測(cè)。RIP裂解液、洗滌液等試劑:確保實(shí)驗(yàn)流程順利進(jìn)行。二、儀器與設(shè)備。qPCR儀:用于進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。離心機(jī):用于沉淀和洗滌步驟中的離心操作。磁力架:如使用磁珠進(jìn)行免疫沉淀,需磁力架輔助。三、實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備。查閱文獻(xiàn),明確實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮土鞒?,設(shè)計(jì)好實(shí)驗(yàn)方案。檢查試劑耗材是否齊全,避免實(shí)驗(yàn)中斷。對(duì)實(shí)驗(yàn)環(huán)境進(jìn)行清潔和消毒,確保無(wú)菌操作。四、實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范。嚴(yán)格遵守RNA操作規(guī)范,避免RNA降解。確保所有步驟在適當(dāng)?shù)臏囟群蜁r(shí)間下進(jìn)行。注意實(shí)驗(yàn)安全,佩戴手套、護(hù)目鏡等防護(hù)用品??傊龊肦IP-qPCR實(shí)驗(yàn)需要充分的實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備,包括實(shí)驗(yàn)材料與試劑、儀器與設(shè)備、實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備以及嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范。只有充分準(zhǔn)備,才能確保實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行和結(jié)果的準(zhǔn)確性。
RIP實(shí)驗(yàn)將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA的方法:
標(biāo)記適當(dāng)數(shù)量的0.2mLPCR管,以供分析的樣本數(shù)量,并放在冰上。
將9μL(至多2μg)的RNA加入PCR管中,放在冰上。
在每個(gè)PCR反應(yīng)管的在冰上加入適量的試劑。
將PCR反應(yīng)管置于熱循環(huán)器中。
啟動(dòng)以下RT反應(yīng)程序:37℃,1h;95℃,5min,4℃保存。
取下PCR管。用180μL無(wú)核酸酶水(稀釋10倍)稀釋產(chǎn)物。產(chǎn)物可以存儲(chǔ)在-20°C。
廣州基云生物,在IP互作組檢測(cè)和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗(yàn)證領(lǐng)域,具有豐富的經(jīng)驗(yàn),助力您的互作機(jī)制研究。 RIP實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理是什么。
RIP-Seq檢測(cè)和RIP-qPCR驗(yàn)證優(yōu)劣勢(shì):優(yōu)勢(shì):高通量獲得目的蛋白的專屬RNA互作庫(kù),獲得目的蛋白的互作RNA機(jī)制分子。劣勢(shì):RIP-Seq的RNA庫(kù)魚(yú)龍混雜,包含目的蛋白的直接/間接的互作RNA,非特異結(jié)合,殘留RNA。RIP-Seq技術(shù)和分析門檻高;RIP-qPCR驗(yàn)證成功率低,導(dǎo)致研發(fā)進(jìn)展反復(fù)跌宕、時(shí)間和經(jīng)費(fèi)成本占用較大,嚴(yán)重影響士氣。該項(xiàng)目的成功實(shí)施,比較依賴成熟和有分析經(jīng)驗(yàn)的團(tuán)隊(duì),強(qiáng)烈建議整包交給專業(yè)的服務(wù)商開(kāi)展檢測(cè)。
廣州基云專注互作機(jī)制研究,致力于讓實(shí)驗(yàn)更簡(jiǎn)單高效。 若想要快速了解RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù),可以采取哪些方法。上海RNA蛋白相互作用RIP-Sequencing檢測(cè)
RIP-seq實(shí)驗(yàn)廣泛應(yīng)用于研究全基因組RNA-蛋白質(zhì)相互作用及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制。內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR
RIP-qPCR是一種檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作的靶向驗(yàn)證技術(shù)。該技術(shù)通過(guò)聯(lián)合免疫共沉淀技術(shù)和RT-qPCR檢測(cè)技術(shù),對(duì)目的蛋白在特定細(xì)胞/組織內(nèi)的蛋白/RNA互作關(guān)系進(jìn)行驗(yàn)證,明確蛋白/RNA的相互作用關(guān)系。該技術(shù)適用于目的蛋白在特定細(xì)胞/組織中的蛋白/RNA互作檢測(cè)驗(yàn)證,或用于不同遺傳背景/實(shí)驗(yàn)條件下的互作差異研究。因此,該技術(shù)是研究細(xì)胞內(nèi)蛋白/RNA互作調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的常規(guī)檢測(cè)技術(shù)。
RIP-qPCR:用于驗(yàn)證目的蛋白和候選RNA的相互作用關(guān)系,或用于不同遺傳背景/實(shí)驗(yàn)條件下的互作變化。 內(nèi)蒙古RNA免疫共沉淀RIP-RT-PCR