聚合酶鏈反應允許快速生產短DN段，即使已知的引物序列不超過兩個。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法，例如生成雜交 探針用于 Southern 或northern blot 雜交。聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA，有時是單鏈的，甚至可以從非常少量的起始材料中進行分析。脫氧核糖核酸測序的任務也可以通過聚合酶鏈反應來輔助完成。已知的DN段可以很容易地從患有遺傳疾病突變的患者體內產生。對擴增技術的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段，或者可以產生感興趣區域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統的 DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體，這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”，它還可以分析或提取已經插入載體的片段。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產生突變(通用的或定點的)插入片段。聚合酶鏈反應具有定量合成產物的優點。徐州特殊樣本熒光定量PCR原理

聚合酶鏈式：PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成：模板DNA的變性：模板DNA經加熱至93℃左右一定時間后，使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離，使之成為單鏈，以便它與引物結合，為下輪反應作準備；模板DNA與引物的退火(復性)：模板DNA經加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合；引物的延伸：DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP為反應原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復制原理，合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈重復循環變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的“半保留復制鏈”，而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。每完成一個循環需2-4分鐘，2-3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平臺期(Plateau)所需循環次數取決于樣品中模板的拷貝。　PCR技術敏感性高，特異性強，操作簡便、快速，在生命科學研究、食品衛生、醫療、法醫及環境監測等諸多方面都具有重要的應用價值。廈門分子生物學Real-time PCR網站熱啟動聚合酶鏈式反應可以通過將反應組分加熱到變性溫度在加入聚合酶之前。

聚合酶鏈反應的一個主要限制是，為了產生允許其選擇性擴增的引物，需要關于目標序列的先前信息。這意味著，通常情況下，PCR用戶必須知道兩個單鏈模板中每個模板上目標區域上游的精確序列，以確保DNA聚合酶正確結合引物-模板雜交體，并隨后在DNA合成過程中產生整個目標區域。像所有酶一樣，DNA聚合酶也容易出錯，這反過來會導致產生的PCR片段發生突變。PCR的另一個限制是，即使是很少量的污染DNA也可以被擴增，導致誤導或模糊的結果。為了很大限度地減少污染的可能性，調查人員應該為試劑制備、聚合酶鏈反應和產品分析預留單獨的房間。試劑應分配到一次性的等分試樣中。應經常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。

industryTemplate電子聚合酶鏈反應用于計算理論聚合酶鏈反應結果。

聚合酶鏈反應：多重連接依賴探針擴增（MLPA):允許用單個引物對擴增多個靶標，從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應:由單個PCR混合物中的多個引物組組成，以產生對不同DNA序列特異的不同大小的擴增子。通過同時靶向多個基因，可以從單次測試中獲得額外的信息，否則將需要幾次試劑和更多時間來執行。每個引物組的退火溫度必須優化，以在單個反應中正確工作，并符合擴增子尺寸。也就是說，當通過凝膠電泳可視化時，它們的堿基對長度應該足夠不同以形成不同的條帶。聚合酶鏈反應的一個主要限制是，為了產生允許其選擇性擴增的引物，需要關于目標序列的先前信息。寧波微量熒光PCR原理及步驟

熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現的，這些酶在環境溫度下不活躍。徐州特殊樣本熒光定量PCR原理

聚合酶鏈式反應的步驟：標準的PCR過程分為三步：DNA變性：（90℃-96℃）：雙鏈DNA模板在熱作用下，氫鍵斷裂，形成單鏈DNA；退火：（60℃-65℃）：系統溫度降低，引物與DNA模板結合，形成局部雙鏈。延伸：（70℃-75℃）：在Taq酶（在72℃左右，活性很好）的作用下，以dNTP為原料，從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸，合成與模板互補的DNA鏈。每一循環經過變性、退火和延伸，DNA含量即增加一倍。現在有些PCR因為擴增區很短，即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成，因此可以改為兩步法，即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。徐州特殊樣本熒光定量PCR原理