工廠化循環水從水處理的側重點不同分為機械模式和生化模式，主要區別就是看能耗大小，本文所講的是生化模式。這個模式能否成功，與虹吸能否順利運行有直接關系，虹吸設備需要時常維護否則會莫名其妙的失效。有人說：我都準備投入了30萬，你告我天天還得維護，這是搞毛線啊？虹吸失敗的話，整個系統視養殖密度在兩天到四天以內崩潰----魚蝦死光光。工廠化循環水系統的重點是凈水系統，占比50%；生物習性占30%；其他的溶氧恒溫等條件的占比20%。

每平方米放苗250～400尾，暫養后的大蝦苗放養密度可減少20%～30％；實行三級養殖時**級每平方米可放養蝦苗1000～1200尾，二級每平方米放養500～800尾，三級每平方米放養250～300尾。在低鹽度或淡水中養殖凡納濱對蝦時，必須對蝦苗進行淡水馴化。在育苗室淡化速度每日鹽度降低不超過5，降至5時便可直接向微鹽池塘中放苗。在淡水池養殖，應選擇在鹽度1以下水中穩定培育3天以上的蝦苗，亦可先向池塘內加入20～30厘米的淡水，再用出鹽前的鹵水或海水素（精）調節至適宜的鹽度放養蝦苗，經數日暫養后，再逐日加入淡水。

水體的鹽度和硬度都能達到飽和進而析出，所以必須在系統內部放置植物。可以在水體內放置水葫蘆、空心菜、浮萍等，也可以在硝化池種蔬菜比如西紅柿樹、地瓜樹、西瓜、土豆，矮化的果樹也是可以的。在水池內放置水葫蘆則需要注意不能被魚吃掉了。這樣植物還會遮光，避免魚被日光照射，同時還能收獲大量蔬菜和魚食。整個系統是需要日光的，一來是植物光合作用消耗肥水無機鹽，再就是給水體加溫，應盡可能的加大日光采集。