在目前的發展水平下，循環水養殖模式較高的準入門檻使得循環水養殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養殖品種有限，限制了循環水養殖模式的發展。近些年來，經過專家學者和眾多的養殖企業的不斷探索，國內循環水養殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環水養殖系統既是一個復雜的系統工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養殖品種的循環水養殖系統，只要不出現明顯的設計漏洞，系統運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統管理技術和養殖技術來解決。

目前我國的循環水養殖系統技術的系統設施和養殖生產處于相脫節的狀況，也就是說只有少數人真正掌握循環水養殖設施正常管理技術，大多數已建的循環水養殖設施很大一部分不能正常運轉。究其原因，一是循環水養殖管理要求復雜，技術上有缺陷，不易實現平穩運行；二是一般養殖場的人員素質和結構不能滿足循環水養殖的要求。因此，今后養殖設施的開發應更加注重從整體上整合養殖設施和養殖技術，做到“軟硬件”真正的統一，并不斷提高設施的信息化和智能化水平，降低管理維護難度。

突破海水工廠化循環水養殖的技術難點 集成國內外先進水處理技術，創新海水養殖水處理新模式、新技術，開發“經濟(造價低)、實用(滿足生產功能要求)、好用(生產管理方便)”，能夠滿足不同用戶、不同養殖對象生產需求的設施設備。研究工廠化循環水養殖的關鍵生產技術 高密度養殖條件下，密度脅迫作用會引起動物機體產生一系列生理變化，研究養殖對象在高密度環境下的適應機制，掌握養殖和育苗生產中的適當放養密度。