在定量PCR時，我們常常糾結一個問題，究竟是相對定量還是***定量呢？如今，你無需糾結了，因為數字PCR（digitalPCR）來了。盡管這兩種技術有些類似，都是估計起始樣品中的核酸量，但它們有一個重要的區別。定量PCR是依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量，而數字PCR則讓你能夠直接數出DNA分子的個數，是對起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應用領域：拷貝數變異、突變檢測、基因相對表達研究（如等位基因不平衡表達）、二代測序結果驗證、miRNA表達分析、單細胞基因表達分析等。影響dPCR定量結果的因素：儀器采用的分散方式與數量、溶液稀釋方法、分散體積的準確性以及結果表達方式。法國醫療系統認證數字PCR技術

數字聚合酶鏈式反應（digitalpolymerchainreaction，dPCR）技術因具有高靈敏度、受基質干擾少等優勢而被廣用于轉基因食品檢測。本研究綜述了數字PCR技術的原理、系統各部件的優劣勢，梳理了數字PCR技術在轉基因檢測與溯源技術（標準物質）方面的進展和發展趨勢，以期為轉基因食品檢測領域提供參考依據。dPCR的擴增過程大致上可以分為3步：樣品的分散、樣品的熱循環擴增和樣品的檢測。對于數字PCR儀器系統，各個部件之間仍然有較大的改進空間，要發揮部件之間的協同作用是很重要的，而且有持續研究的價值。表1中總結了部分常見的數字PCR系統的類型，以及相對在硬件、便攜性、性價比和自動化程度上的比較。廣東數字PCR儀器數字PCR是通過將一個樣本分成幾十到幾萬份，分配到不同的反應單元，每個單元至少包含一個拷貝的目標分子 。

dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結果偏差。體積誤差對于測量拷貝數濃度會產生偏差。目前dPCR中體積優化方法以光學顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數結果的不確定性，Emslie等使用光學顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異，考察了數字PCR系統中每個微孔內和孔與孔間的體積差異對實驗結果的影響程度。Corbisier等使用微滴數字PCR對6種不同質量分數棉籽粉質粒DNA標準物質[ERM-AD623a-f，濃度范圍（10~10）copies/ul]進行分析，優化了液滴體積得到相應校正因子，并使用該校正因子發現并校準了運行軟件中液滴體積不變的假設而引起的數據偏離，數據結果的一致性有明顯提高。

目前dPCR主要有兩種形式，芯片式和液滴式，但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應器或微滴中，每個反應器的核酸模板數少于或者等于1個。這樣經過PCR循環之后，有一個核酸分子模板的反應器就會給出熒光信號，沒有模板的反應器就沒有熒光信號。根據相對比例和反應器的體積，就可以推算出原始溶液的核酸濃度?？梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品，包括微孔板，毛細管，油乳劑和帶有核酸結合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設分子種群遵循泊松分布來估計不同分子的數量，根據泊松分布的原理，反應體系中目標分子的拷貝數可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計算，從而解決了多個目標分子存在于單個液滴中的可能性。dPCR在轉基因檢測方面的應用仍處于研究和探索的階段。

由于現有的商業化數字PCR設備在物理上只設置了2個檢測通道，所以存在一個明顯的短板：不能同時進行多個位點的檢測。在樣品多位點的檢測中，就需要更多的起始樣品，但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實現多重檢測。為了考察利用數字PCR實現多重檢測的可能性，英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細胞肺相關的KRAS基因為檢測對象，在Bio-Rad的數字PCR系統上通過3個三重ddPCR檢測體系來實現9個KRAS突變位點的檢測。數字PCR作為研發階段的驗證方案之一。廣東數字PCR儀器

數字PCR技術min檢測下限可到2copies/ml，比qPCR靈敏度提升了100倍。法國醫療系統認證數字PCR技術

數字PCR的引物和探針設計規則同熒光定量PCR是類似的，具體規則如下：1、查找和選擇目標序列設計引物和探針的第一步是得到感興趣基因的核酸序列。找到基因保守區域：基因的保守區域是指來自同一屬/種/亞型的、在某個基因上堿基序列差別很小或沒有差別的區域。根據需要，使用ClustalX或ClustalW等軟件對齊屬于同一屬/種/亞型的基因的一組序列，在對齊序列的保守區域設計引物，并確保引物結合位點處的保守序列與其它非待檢測的屬/種/亞型的堿基序列具有較大的差異。擴增產物長度（AmpliconLength）：可在75-200bp之間（產物長度=下游引物位置-上游引物位置+1）。法國醫療系統認證數字PCR技術

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