生化過濾依靠的是硝化細菌，硝化細菌的數量直接影響凈水效能。硝化細菌的數量和濾材的表面積有關：表面積越大就能附著越多的硝化細菌。有資料顯示，火山石的比表面積是300平方米/立方，K1是500平方米/立方。還有一種micro k1的東西，國內電商平臺上面沒有見過，比表面積是950平方米/立方。常見的過濾還有沼澤過濾，這個屬于是被動過濾，濾材上的硝化細菌因為得不到足夠的氧氣，硝化反應比較慢，大多數商超暫養用的就是這種過濾，優點是建造完成后基本無需維護。

保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據要求調節水溫和換水量。養殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝/酸鹽、硝/酸鹽、磷酸鹽等相關指標，將各項指標控制在合適的范圍內。當水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創造一個良好生長的環境。

在使用循環水養殖系統后，企業能耗費用明顯降低，養殖池水經過處理后循環使用，降低了企業取水成本，水質明顯提高，魚蝦發生病害幾率迅速降低，每年可為企業節約費用達幾十萬元。工廠化循環水養殖模式具有節水、節地、生態環保、生產可控性強、高密度、低風險、水產品質量安全等優點，被認為是代表21世紀水產養殖業發展的主導方向之一。我國作為世界水產養殖大國，推廣工廠化循環水養殖模式。推進水產養殖技術向高端、精準、節能、高產的方向發展。